A ABRAPO teve sua Assembleia de Constituição em 1º de novembro de 2006 com a apresentação e aprovação de seu Estatuto Social e eleição da primeira diretoria. O ano de 2007 foi investido na estruturação da Associação com a criação de seu Regimento Interno e das Comissões. A partir de 2008 vários eventos científico-culturais foram realizados, e novos projetos tornaram-se realidade, como o Projeto de Atendimento Clínico Acessível com a perspectiva de ampliar as possibilidades de acesso à psicoterapia.

O propósito da Associação Brasileira de Análise Psico-Orgânica é congregar os profissionais que trabalham com a abordagem psicoterapêutica da Análise Psico-Orgânica (APO), promover iniciativas que permitam ao associado dar continuidade ao seu desenvolvimento profissional, fomentar espaços de pesquisa e produção científica e o intercâmbio relacional entre seus associados. 

Ao se tornar membro associado, o psicoterapeuta se compromete a respeitar o Código Deontológico e os critérios éticos definidos pela Associação, que constam no Regimento Interno em conformidade com os princípios adotados pela E.A.P.O.A. (European Association for Psycho-Organic-Analysis), membro da E.A.P. (European Association for Psychotherapy), reconhecido como método pela E.W.A.O. (European Wide Accrediting Organization). O Código Deontológico abriga os princípios éticos tanto para o exercício da psicoterapia quanto para as relações entre colegas profissionais.

Para se tornar membro associado, é necessário ter concluído a formação em Análise Psico-Orgânica e se comprometer, mediante assinatura do Termo de Compromisso, a respeitar o Código Deontológico e os critérios éticos definidos pela Associação. A adesão é voluntária, e o associado se compromete com o pagamento da taxa de anuidade.